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石遵计

发布时间:2021-06-10 字体大小 T |T

 

一、个人简介

石遵计,湖北大冶人,博士,青年研究员(正高四级岗),硕士生导师

研究领域:利用微生物组学、代谢组学和分子生物学研究微生物和动物互馈机制; 微生物原位修复草地动物养殖业中土壤和水体重金属污染

电子邮件:shizj@lzu.edu.cn

通讯地址:甘肃省兰州市城关区天水南路222号兰州大学草地微生物研究中心307

微生物中心平台及本实验室拥有代谢组学和微生物组分析平台,拥有完善的分子生物学仪器设备,擅长利用微生物组学、代谢组学和分子生物学研究解析微生物组、动植物和环境的关系。与美国蒙大拿州立大学蛋白质组学和代谢组学研究中心、中科院精密测量科学与技术创新研究院生物医学代谢组、农业微生物国家重点实验室环境微生物组、广东金骏康生物技术有限公司、武汉迈特维尔生物科技有限公司、上海美吉生物医药科技有限公司有着密切的合作关系。欢迎对微生物组学、代谢组学、生物信息学和对科研感兴趣的优秀学生报考研究生!让我们一起步入科学的殿堂!

 

二、教育和科研经历

2021.05-至今:兰州大学,草地微生物研究中心/草地农业科技学院,青年研究员

2018.10-2020.11:中科院精密测量科学与技术创新研究院/华南理工大学,微生物学,联合培养博士后,合作导师:张利民研究员,国内著名代谢组学专家 / 曾新安教授,国内著名食品科学专家

2015.07-2018.08:华中师范大学,微生物学,博士后,合作导师:谢波教授 微生物学专家

2009.09-2015.06:华中农业大学农业微生物国家重点实验室,微生物学,博士,导师:王革娇教授 国内著名环境微生物学专家

2012.12-2014.12:美国蒙大拿州立大学代谢组学和蛋白质组学研究中心,微生物学,国家公派联合培养博士生,导师:Timothy R. McDermott 国际著名微生物学专家 / Brian Bothner 国际著名代谢组学专家

2005.09-2009.06:石河子大学 (211工程),生物科学,学士

 

三、获奖情况与学术兼职

1. 2006年获“国家奖学金”

2. 2007年获“校级三好学生”

3. 2008年获“校级三好学生”

4. 2009年获“校级优秀毕业生”

5. 2011年获华中农业大学生科院“单项积极分子”

6. 2012年获国家公派留美联合培养博士生资格

7. 2017年指导学生获得第一届全国大学生生命科学竞赛国家三等奖

8. 2018年指导学生获得第三届全国生命科学创新创业大赛国家三等奖

9. 2019年-至今,环境科学Top期刊Chem Eng J (IF=10.6) 审稿人

 

四、承担科研项目

1. 兰州大学人才引进科研启动基金,2021.05-2026.05,100万,主持

2. 广东省佛山市博士后启动基金,脂肪肝防治黄酮类化合物的研发及其平台建立,2018.10-2020.10,20万,主持。

3. 第67批中国博士后科学基金面上基金 (2019M662893),基于代谢研究细菌WN4与集胞藻互作抗镉的分子机制,2019.09-2021.09,8万,主持。

4. 第58批中国博士后科学基金面上基金 (2015M582247),高通量测序和代谢组学分析水华中的细菌种类和菌藻互作,2015.11-2017.08,5万,主持。

5. 湖北省自然科学基金项目(2017CFB164),高抗镉细菌促进东南景天对镉吸收的研究,2017.01-2018.12,5万,主持。

6. 中央高校项目验收优秀滚动资助 (CCNU16GD014),贪铜菌镉抗性机理及其对镉污染土壤的原位修复,2018.01-2018.12,6万,主持。

7. 湖北省遗传调控与整合生物学重点实验室项目(GRIB201601),细菌与水稻互作抗镉的机理研究,2016.01-2016.12,3万,主持。

8. 中央高校基本科研业务费 (CCNU16A05009),贪铜菌镉抗性机理及其对镉污染土壤的原位修复,2016.01-2017.12,8万,主持。

9. 中国国家自然科学基金 (61872157),基于多组学数据的微生物高阶相互作用预测关键技术研究,2019.01-2021.12,60万,第三参与人。

10. 广东省佛山市核心技术攻关项目(1920001000262),基于药效物质基础研究的中药炮制标准化与中药开发,2019.10-2022.10,500万,第六参与人。

 

五、研究成果(*通讯作者)

1.  Shi Z, Chen G, Cao Z, Wu F, Lei H, Chen C, Song Y, Liu C, Li J, Zhou, J, Lu Y, Zhang L*. (2021). Gut Microbiota and Its Metabolite Deoxycholic acid Contribute to Sucralose Consumption-Induced Non-alcoholic Fatty Liver Disease. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 69: 3982-3991. (SCI收录, IF=4.2, 1Top, 第一作者)

2.  Lei H, Song Y, Dong M, Chen G, Cao Z, Wu F, Chen C, Zhang C, Liu C, Shi Z*, and Zhang L*. (2021). Metabolomics Safety Assessments of Microcystin Exposure via Drinking Water in Rats. Ecotoxicology and Environmental Safety, 212: 111989. (SCI收录, IF=4.8, 1Top期刊,并列通讯作者)

3.  Shi Z, Lei H, Chen G, Yuan P, Cao Z, Ser H, Zhu X, Wu F, Liu C, Dong M, Song Y, Guo Y, Chen C, Hu K, Zhu Y, Zeng X, Zhou J, Lu Y, Patterson A.D., Zhang L*. (2021). Impaired intestinal Akkermansia muciniphila and aryl hydrocarbon receptor contribute to artificial sweetener-induced hepatic steatosis. mSystems, 6 (1): e00985-20. (SCI收录, IF=6.6, 2区期刊,第一作者, Editor's Pick paper)

4.  Shi Z, Qi X, Zeng X, Liu Y, Zhou J, Cui K*, Zhang L*. (2020). A newly isolated bacterium Comamonas sp. XL8 alleviates the toxicity of cadmium exposure in rice seedlings by accumulating cadmium. Journal of hazardous materials, 403:123824. (SCI收录, IF=9.03, 1Top期刊,第一作者)

5.  Shi Z, Zhang ZF, Yuan M, Wang S, Yang M, Yao Q, Ba W, Zhao J, Xie B*. (2020). Characterization of a high cadmium accumulating soil bacterium, Cupriavidus sp. WS2. Chemosphere, 247: 125834. (SCI收录, IF=5.8, 2Top期刊,第一作者)

6.  Shi Z, Shen W, Yang K, Zheng N, Jiang X, Liu L, Yang D, Zhang L, Ai Z* and Bo Xie* (2019). Hexavalent chromium removal by a new composite system of dissimilatory iron reduction bacteria Aeromonas hydrophila and nanoscale zero-valent iron. Chem Eng J, 362: 63-70. (SCI收录, IF=10.6, 1Top期刊,第一作者)

7.  石遵计,曹政,胡科鑫,彭鑫碧,朱一帆,谢波*. 镉离子污染条件下微生物群落中细菌与藻类的相互作用. 微生物学报, 2019, 59(6): 1156-1163. (权威期刊CSCD, 第一作者)

8.  Lukaszewska1 M, Shi Z1, Tripet B, McDermott TR, Copié V, Bothner B*, Wang G*. (2017). Metabolic response of Agrobacterium tumefaciens 5A to arsenite. Environ Microbiol, 19(2): 710-721. (SCI收录, IF=5.147, 2, 并列一作, highlight paper)

9.  Shi Z, Cao Z, Qin D, Zhu W, Wang Q, Li M, Wang G*. (2013) Correlation models between environmental factors and bacterial resistance to antimony and copper. PLoS ONE 8(10): e78533. (SCI收录, IF=3.023区,第一作者)

10. Wu F, Shi Z, Lei H, Chen G, Yuan P, Cao Z, Chen C, Zhu X, Liu C, Dong M, Song Y, Guo Y, Zhou J, Lu Y, Zhang L*. (2021) Short-Term Intake of Hesperetin-7?O?Glucoside Affects Fecal Microbiota and Host Metabolic Homeostasis in Mice. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 69: 1478-1486. (SCI收录, IF=4.2, 1Top,第二作者)

11. Dong M, Yuan P, Song Y, Lei H, Chen G, Zhu X, Wu F, Chen C, Liu C, Shi Z, Zhang L.* (2020) In vitro effects of Triclocarban on adipogenesis in murine preadipocyte and human hepatocyte, Journal of Hazardous Materials 399: 122829 (SCI收录, IF=9.03, 1Top期刊,第十作者)

12. Wu G, Ge L, Zhao N, Liu F, Shi Z, Zheng N, Zhou D, Jiang X, Halverson L, Xie Bo*. (2020) Environment dependent microbial co-occurrences across a cyanobacterial bloom in a freshwater lake. Environ Microbiol DOI: 10.1111/1462-2920.15315. (SCI收录, IF=5.147, 2区,第五作者)

13. Rawle R, Tokmina-Lukaszewska M, Shi Z, Kang Y, Tripet B, Dang F, Wang G, McDermott T, Copie V*, Bother B*. (2020) Metabolic Responses to Arsenite Exposure Regulated through Histidine Kinases PhoR and AioS in Agrobacterium tumefaciens 5A. Microorganisms 8: 1339. (SCI收录, IF=4.15, 2, 第三作者)

14. Kang YS, Shi Z, Bothner B, Wang G, McDermott TR*. (2014) Involvement of the Acr3 and DctA anti-porters in arsenite oxidation in Agrobacterium tumefaciens 5A. Environ Microbiol 17(6): 1950-1962. (SCI收录, IF=5.1472区,第二作者)

15. Shi Z, Luo G, Wang G*. (2012) Cellulomonas carbonis sp. nov., isolated from coal mine soil. Int J Syst Evol Microbiol 62: 2004-2010. (第一作者)

16. Chen F, Shi Z, Wang G*. (2012) Arenimonas metalli sp. nov., isolated from iron mine. Int J Syst Evol Microbiol 62: 1744-1749. (第二作者)

17. Luo G, Shi Z, Wang G*. (2012) Lysobacter arsenitoxydans sp. nov., an arsenite-oxidizing bacterium isolated from iron mining soil. Int J Syst Evol Microbiol 62: 1659-1665. (第二作者)

18. Luo G, Shi Z, Wang H, Wang G*. (2012) Skermanella stibiiresistens sp. nov., a highly antimony-resistant bacterium isolated from coal mining soil, and emended description of the genus of Skermanella. Int J Syst Evol Microbiol 62: 1271-1276. (第二作者)

19. Li L?, Liu H?, Shi Z, Wang G*. (2013) Sphingobium cupriresistens sp. nov., a copper-resistant bacterium isolated from copper mine soil, and emended description of the genus Sphingobium. Int J Syst Evol Microbiol 63(Pt 2): 604-9. (第二作者)

 

六、学生培养

欢迎草学、微生物学、畜牧学、生物医学、分析化学等相关专业背景的学生报考硕士研究生,同时欢迎本科生做科研训练或毕业设计,热烈欢迎热爱科研的有志青年加入。

 

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